Der Verzehr von Leinsamen im Ganzen unterstützt die Darmtätigkeit und fördert die Verdauung, jedoch werden die Nährstoffe weniger gut aufgenommen, da die Samen oft im Ganzen durch den Verdauungskanal gelangen. Leinsamenmehl wird besser absorbiert, so dass die wertvollen Nährstoffe verwertet werden können.
Es reduziert die Produktion von Magensäure.
Leinsamenmehl kann als Ersatz für einen Teil des herkömmlichen Mehls verwendet werden, aber auch unter Salate, Müsli oder Hüttenkäse gemischt, in Gebäckteig oder Scones eingearbeitet oder darüber gestreut werden. Es eignet sich auch zum Eindicken, da es große Mengen an Flüssigkeit und Fett aufnehmen kann. Mit Sesammehl gemischt schützt es die Zähne.
Es kann auch von Menschen verzehrt werden, die sich glutenfrei ernähren.